Все накопленные данные автоматически не удаляются. Либо вы удаляете данные вручную, либо создаете новый «Битрикс24» и продолжаете работу с ним. 

У нас есть несколько рекомендаций: 

- если вы работаете на бесплатном тарифе и у вас появилась необходимость удалить все-все ваши данные, лучше создать новый «Битрикс24» и начать с чистого листа там. 

- если  вы работаете на платном тарифе, то все данные все же нужно будет удалять вручную.