Откройте любой интересующий вас Диск, например, Общий диск и выберете напротив поля "Показать" пункт "Корзину":
Таким образом откроется страница, в которой будут находиться все удаленные из данного Диска файлы, с возможностью очистить корзину:
Обратите внимание, что вы не сразу увидите результат очистки корзины в разделе Мой Тариф--Мой Битрикс24, поскольку информация об освобожденном месте обновляется раз в сутки.